Differential expression analysis for RNAseq using Poisson mixed models
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Differential expression analysis for RNAseq using Poisson mixed models
Identifying differentially expressed (DE) genes from RNA sequencing (RNAseq) studies is among the most common analyses in genomics. However, RNAseq DE analysis presents several statistical and computational challenges, including over-dispersed read counts and, in some settings, sample non-independence. Previous count-based methods rely on simple hierarchical Poisson models (e.g. negative binomi...
متن کاملRNAseq Differential Expression Analysis
Dataset taken from Somel et al. 2012: (check publication for details) • 3 human + 3 chimp brain transcriptome data • Illumina RNA-Seq, paired-end 76bp • Reads mapped to human and chimp genome and reads counted for each transcript Download the following data files into a directory of your choice (e.g. data): • Human: http://www.nowick-lab.info/wp-content/uploads/2013/12/segemehl.hg19.readCount.t...
متن کاملa new approach to credibility premium for zero-inflated poisson models for panel data
هدف اصلی از این تحقیق به دست آوردن و مقایسه حق بیمه باورمندی در مدل های شمارشی گزارش نشده برای داده های طولی می باشد. در این تحقیق حق بیمه های پبش گویی بر اساس توابع ضرر مربع خطا و نمایی محاسبه شده و با هم مقایسه می شود. تمایل به گرفتن پاداش و جایزه یکی از دلایل مهم برای گزارش ندادن تصادفات می باشد و افراد برای استفاده از تخفیف اغلب از گزارش تصادفات با هزینه پائین خودداری می کنند، در این تحقیق ...
15 صفحه اولFactors Affecting Hospital Length of Stay Using Mixed Poisson Regression Models
Background and purpose: Modeling of Hospital Length of Stay (LOS) is of great importance in healthcare systems, but there is paucity of information on this issue in Iran. The aim of this study was to identify the optimal model among different mixed poisson distributions in modeling the LOS and effective factors. Materials and methods: In this cross-sectional study, we studied 1256 records, inc...
متن کاملanalysis of ruin probability for insurance companies using markov chain
در این پایان نامه نشان داده ایم که چگونه می توان مدل ریسک بیمه ای اسپیرر اندرسون را به کمک زنجیره های مارکوف تعریف کرد. سپس به کمک روش های آنالیز ماتریسی احتمال برشکستگی ، میزان مازاد در هنگام برشکستگی و میزان کسری بودجه در زمان وقوع برشکستگی را محاسبه کرده ایم. هدف ما در این پایان نامه بسیار محاسباتی و کاربردی تر از روش های است که در گذشته برای محاسبه این احتمال ارائه شده است. در ابتدا ما نشا...
15 صفحه اولذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Nucleic Acids Research
سال: 2017
ISSN: 0305-1048,1362-4962
DOI: 10.1093/nar/gkx204